南京中科药业有限公司系南京中科集团股份有限公司（中科灵芝）下属的全资子公司，于2005年4月成立。1998年进驻深圳。投资4000万的中科江宁（GMP）生产基地具片剂、水剂、注射剂等全部剂型的生产能力，各种硬件设备达到先进医药企业标准，生产区全封闭作业且达到十万级标准。2005年12月，公司一举通过ISO9001质量管理体系、ISO14000环境管理体系及OHSMS18000职业健康安全管理体系认证。2006年1月，公司通过江苏省药监局现场审核，获得药品生产许可证，2007年11月又通过了国家食品药品监督管理局药品GMP认证。拥有国内一流的高标准实验室及检测室，无菌达到万级标准，主要操作台经多层空气净化，可达到百级标准，硬件设备达到先进医药企业标准，生产区全封闭作业且达到十万级标准。公司2002年通过生产良好规范（GMP）。2005年5月18日已正式竣工投产，是目前国内先进的生产工厂之一。